НИИ Гигиены и охраны здоровья детей и подростков ФГАУ «НМИЦ здоровья детей» Минздрава России, имеет соглашения о сотрудничестве как с международными организациями: сеть «Школы для здоровья в Европе — SHE», так и с российскими научными, образовательными и медицинскими организациями. Имеется сотрудничество с центром социальной помощи семье и детям «Гармония».